Kategorie pro internetové obchody je v české sekci katalogu tak trochu samostatná. Její náplní jsou odkazy na stránky, na kterých je možné nakupovat prostřednictvím internetu.
V této kategorii také platí mírně odlišná pravidla pro navrhování stránek. Podle pravidel se má každý odkaz navrhovat do každé oblasti katalogu (tématická/regionální oblast v příslušné jazykové sekci) jen jednou a nemají se navrhovat odkazy na podstránky. Nicméně v internetových obchodech lze přijmout odkaz na podstránku, kterou představuje internetový obchod.
Například výrobce nábytku, který má poměrně obsahově bohatý web s informacemi o firmě, referencemi, ukázkami prací, nabídkou služeb a také s vlastním internetovým obchodem (na stejné či jiné doméně) může být zařazen jak v příslušné kategorii Obchod a služby, kde bude zařazena přímo hlavní stránka, tak může být přímý odkaz na internetový obchod zařazen v příslušné kategorii v Internetových obchodech. Neznamená to však, že je tento postup vhodný ve všech případech - je možný pokud je kvalitní jak samotná stránka o firmě provozující obchod, tak obchod samotný.
Na druhou stranu je tato kategorie mnohem přísnější na obchody jako takové a je zde poměrně přísný výběr. Editoři se na internetové obchody dívají z pohledu uživatele - spotřebitele a podle informací na stránkách zkoumají zda-li obchod splňuje dosti striktní podmínky. Zejména je důležité korektní chování vůči spotřebiteli a jednání v souladu s příslušnými zákony, které se na prodej v internetových obchodech vztahují.
Jak již bylo řečeno jedná se o výběrový katalog a cílem je vybírat takové stránky, které mohou být prospěšné a užitečné běžným uživatelům internetu. Do kategorie pro internetové obchody byla (a v menší míře stále ještě je) navrhována celá řada obchodů, které pošlapávaly úplně základní práva spotřebitele. Bylo celkem běžné narazit na obchod, který měl v kontaktech uvedenou e-mailovou adresu, telefon a ICQ a spotřebitel v tomto případě nevěděl u jakého subjektu nakupuje. Velmi rozšířeným nešvarem je rovněž klamání spotřebitelů ohledně záruky, reklamace a možnosti odstoupení od smlouvy do 14 dnů (viz příslušný zákon). Obchody, které řádně neiformují či klamou spotřebitele (a jednají tak v rozporu se zákonem) nejsou považovány za korektní a právě proto jsou obchody posuzovány skutečně velmi přísně.
Zákony upravující prodej v internetových obchodech jsou nastaveny tak, aby chránili ve větší míře práva a zájmy spotřebitelů (z hlediska katalogu uživatelů). Z pohledu katalogu je přístup obdobný - vybírat takové obchody, které jsou pro uživatele výhodné a respektují jejich zájmy. Zákony tedy poměrně přesně definují jasné podmínky pro internetové obchody, které se dají zároveň na základě obsahu poměrně dobře objektivně posuzovat. Jejich aplikováním tak není nutné vytvářet vlastní obdobná pravidla a stránky je přitom možné hodnotit na vyšším stupni objektivity, protože je přesně specifikováno co na nich má být. Na počátku aplikace těchto pravidel neprošla drtivá většina stránek (až přes 90%), takže jejich efektivita byla na vysoké úrovni. Dnes je situace již o něco lepší, mnohé obchody si berou pravidla hry k srci, ale mnohé stále ještě ne.
Je nutné aby obchod splňoval podmínky uvedené v zákoně (aslepoň ty které se dají zdravým rozumem vysvětlit), řádně informoval spotřebitele o pravidlech nakupování a o výrobcích a nesnažil se spotřebitele krátit na jeho právech nebo jakkoliv klamat. Provozovatelům internetových obchodů, kteří si nejsou jisti doporučuji nastudování příslušné problematiky. Užitečné informace rovněž naleznete na následujících stránkách:
Poznámka: tyto dokumenty se vztahují k ceritifikacím internetových obchodů. Certifikace není v žádném případě podmínkou; tyto dokumenty však obsahují užitečné informace.Aktuálně platná pravidla pro internetové obchody hledejte v popisku kořenové kategorie Internetové obchody na adrese http://dmoz.org/World/%c4%8cesky/Internetov%c3%a9_obchody/desc.html.